规划是不可能完美无缺的。有很多三线城市，现在也开始规划地铁。内外失衡是南京地铁规划当中的一个主要问题。客观上讲，很多城市的地铁规划都存在着不足。项目用地规划、调规、改规包括国土用途转用都要经过这个部门，其地位不言而喻。自然资源和规划局几乎每一个科室都是要害部门，涉及规划、土地利用等事项，对项目建设至关重要，可以说重要性不相上下。
哪个城市地铁规划最科学？
规划是不可能完美无缺的。客观上讲，很多城市的地铁规划都存在着不足。但这不完全是规划者的责任。中国目前地铁规模最大的两个城市是上海和北京。其实都有不少问题。先看上海，为了节约成本，3号线和4号线共用轨道，而且长度还不短。从当时的角度来看，客流量并不是很大，采用这种模式，从经济角度上来看是很合理的。但问题在于，随着上海地铁客流量的迅速攀升，这种模式导致3号线和4号线整体运能提升受到了很大的限制。
另外，8号线在建设的时候过于保守，采用了小车型小编组，但是建成以后客流迅速攀升，所以8号线虽然不是上海地铁客流最大的线路，但却是最拥挤的一条线。此外，上海的部分换乘站在规划设计上存在着严重缺陷，导致换乘效率很低，非常麻烦。人民广场，虹口足球场，换乘的路程非常长。上海地铁换乘设计，还有一个严重的问题就是换乘站基本上都集中在中心城区。
这就使得城市近郊和远郊区的居民之间的相互交通不能在城市外围解决，而必须进入中心城区换乘，这就增加了中心城区的客流压力。在高峰时期，会进一步加剧地铁的拥挤。再看北京。北京在60年代的时候就修建了两条地铁线，是中国第1个开通地铁的城市。但是这两条地铁一直到80年代以前都没有进行商业运营。在这段时间内，主要是承担一定的礼仪功能，作为外宾或者外地进京干部和群众参观之用。
由于建设的时间较早，所以一二号线其实已经不适应北京当代的需求了。这个当然不是规划者的责任。但是和上海一样，在当代的地铁建设当中，同样存在着过于保守的问题。当然和上海相比，北京地铁的某些问题，不是地铁本身造成的，而是北京在城市规划当中出现的问题。北京没有像上海那样，将城市功能分散到多个地区，依然高度集中在老中心城区。
而北京中心城区的房价过高，使得大量的人不得不到外围购房或者租房。所以北京的潮汐性客流比上海更为明显。这就使得北京地铁的客流压力更大。在二线城市当中，南京地铁的运营里程最长，通达范围最广。但也不是没有问题。南京地铁采用了先大规模建设郊区线，然后强化中心城区地铁建设的模式。所以，南京地铁当中的相当一部分是用来沟通远郊区的。
