长门的轮回眼就是得自宇智波斑，而斑爷之所以拥有忍界之祖六道仙人的轮回眼，是其在快要死去的时候才把自己的永恒万花筒写轮眼进化为轮回眼，轮回眼其实就是写轮眼的进化版，后来才移植给长门的。从神树的眼睛可以看出来，轮回眼和写轮眼有很大可能是来自于神树的九勾玉轮回眼(就简称神树眼了)，轮回眼和写轮眼只是神树眼的分之，六道仙人直接开启轮回眼而不经过万花筒的阶段，而且后代需要移植亲兄弟的万花筒就可以解释了。
长门的轮回眼是怎样来的？
我们知道在《火影忍者》之中晓组织是长门和弥彦他们一起建立起来的，原先的晓组织首领是弥彦，后来在弥彦死后长门才正式成为晓的首领，并在他的手里晓组织不断扩大；而晓组织之所以后来有那么强的实力，也和长门的轮回眼有关系，那么长门的轮回眼是怎样得来的呢？他是天生的吗？长门是谁？长门是雨隐村晓组织的首领，是继半藏之后雨隐村的新一代首领；父母在第二次忍界大战的时候被误杀，当时他就利用轮回眼杀死了误杀自己父母的忍者，后来和弥彦和小南相遇，成为战争孤儿。
后与自来也相遇，并被自来也收为弟子，跟随自来也学习了一段时间的忍术，算是继承了自来也的思想。 不过后来经历弥彦之死，自己也被假扮宇智波斑的带土蛊惑，思想发生改变，认为只有痛苦才能带来真正的和平，对于忍者大国具有很大的仇恨，这估计也是后来他袭击木叶的时候直接摧毁了整个木叶的原因吧，就是希望通过这样的手段来最快的结束战争。
后来更是在自来也去雨隐村探查晓组织的时候杀了自己的老师自来也，可见当时的长门的思想发生了很大的变化，已经不再是自来也见到的时候那样的长门了。长门的轮回眼得自宇智波斑我们知道轮回眼是忍界之祖“六道仙人”的眼睛，是三大瞳术之首；而长门虽然说也是六道仙人的后裔，旋涡一族的后人，但是他在出生的时候应该是没有轮回眼的，毕竟自六道仙人之后忍界就再没有人拥有过轮回眼。
至于为何长门后来会有轮回眼，这个和另一个人有关，那人就是宇智波一族之中最出色的天才：宇智波斑。长门的轮回眼就是得自宇智波斑，而斑爷之所以拥有忍界之祖六道仙人的轮回眼，是其在快要死去的时候才把自己的永恒万花筒写轮眼进化为轮回眼，轮回眼其实就是写轮眼的进化版，后来才移植给长门的。宇智波斑为何会把轮回眼送给长门？而宇智波斑自然不会那么好心的把好不容易得到的轮回眼送给长门，而他选择长门估计也是因为他是旋涡一族的后裔吧，毕竟都是传承自六道仙人，轮回眼移植到他的身体也不会过度的排斥，第二个原因就是他想要利用长门发动“外道·轮回天生之术”把自己重新复活。
而且后来他还派宇智波带土假扮自己接近长门，就是为了让长门接受自己的思想，利用轮回眼把自己给转生回来；只是事以愿违，最后长门还是被鸣人的嘴遁打败，并没有把宇智波斑给转生回来，后来带土还是和药师兜合作，利用秽土转生之术把宇智波斑给重新转生回来。以上就是小爱的观点，在小爱看来，长门虽然也是六道仙人的后裔，旋涡一族的后人，但是并没有遗传六道仙人的轮回眼，他的轮回眼是移植自宇智波斑的眼睛，是由宇智波斑的写轮眼进化而来，而斑爷之所以把轮回眼移植给长门，其目的就是为了在最后的阶段把自己用“外道·轮回天生之术”给转生回来，不过后面还是计划破产，被药师兜用秽土转生之术给转生了。
佩恩的轮回眼是怎样来的？
谢邀。六道仙人之后的一段时间里，忍者世界再无轮回眼。因陀罗、阿修罗经过多个轮回，终于到了宇智波斑和千手柱间这一代，他们分别拥有仙人眼写轮眼和和仙人体，宇智波石碑上记载的被黑绝修改过的文字，只有拥有万花筒写轮眼的宇智波斑才能读懂，这在斑心中燃起了复仇想法。身负亲弟弟泉奈被杀之仇的斑，移植了弟弟的写轮眼开启了永恒万花筒写轮眼。
宇智波与千手争斗多年，最终两家握手言和，但是斑并不被村里人认可，在终结之谷大战中，须佐九尾不敌木遁柱间，全世界都以为斑就此死去，但是拥有万花筒写轮眼的斑牺牲了自己的一只眼睛，对自己施加了宇智波的禁术伊邪纳岐，并且在倒地之前咬下了柱间的一块肉含在嘴中。尸体就这样被埋在石棺中，当斑醒来时，召出影分身继续藏在石棺里，吐出口中柱间的肉，后来移植到自己身上，这样斑就拥有了宇智波和千手的力量，他开启了轮回眼。
其实对于六道仙人直接开轮回眼的原因，如果说岸本有关于生物的基础的话，实在是太厉害了，从遗传的角度来说，因为神树才是一切除了仙术以外的超自然力量的根本来源，而辉夜的大部分力量则来自于神树，然后通过遗传，传给了羽村和羽衣，而羽村由写轮眼直接开轮回眼。不经过万花筒的原因可以理解为遗传的完整性，因为六道仙人是辉夜的直系亲属，所以对于辉夜留下来的关于神树的基因比较完整，而开启轮回眼的条件只是为了凑齐六道仙人，或者是辉夜的一部分能力，然后，激发由血脉中隐藏的辉夜的基因从而开启轮回眼的话就可以解释得通了。
从神树的眼睛可以看出来，轮回眼和写轮眼有很大可能是来自于神树的九勾玉轮回眼(就简称神树眼了)，轮回眼和写轮眼只是神树眼的分之，六道仙人直接开启轮回眼而不经过万花筒的阶段，而且后代需要移植亲兄弟的万花筒就可以解释了。因为经历了数代人下来，辉夜的基因已经不是那么完整，神树的基因由于缺失已经有了缺陷，所以万花筒才会有失明的风险，而通过近亲移植，则很大程度上的弥补了基因的缺陷，不要说都是一个父母哪来的基因弥补，因为即使是同一个父母生下的两个孩子，相同的基因片段也不是完全一样的，基因交叉互换自由组合的时候也已经将一段基因分在两个镜子里面了。
基因缺陷有一定程度上的弥补之后，辉夜的基因相对比较完整了，于是万花筒的缺陷才会消失，变成永不失明的永恒万花筒，而六道仙人本身的辉夜基因就很完整，所以应该是直接开启永恒万花筒的，但是六道仙人又满足了开启轮回眼的条件，就是辉夜的阴阳查克拉(这是我的推测)因为石碑上说当具有永恒万花筒的人具备了宇智波和千手的力量后就是森罗万象，也就是轮回眼，所以永恒眼就被略过了，直接显示轮回眼。
