首先，病毒在生命进化中起到重要作用。达尔文的自然选择学说给我们提供了一个生命进化的理论，病毒感染对于生命来说就是一种选择压力。适者生存，在病毒面前弱不禁风的个体会被淘汰掉，病毒是生物进化的强大驱动力，它们在一定程度上决定着什么能存活什么能灭亡。在现代测序技术的发展下，人类基因组已经得到破译，在人类的基因组中发现了病毒的基因存在，甚至一些具有重要功能的基因可能最初就是来源于病毒，这些证据说明，病毒在生命进化过程中，也能起到正向的作用。
其次，病毒在免疫系统的进化中起到重要作用。在病毒的海洋中，人类能够生存主要是因为我们拥有一个完善的防卫系统来监视和清除病毒等病原体，如果这个系统出现问题，人体就会变得弱不禁风，这个防卫系统就是免疫系统。人类免疫缺陷病毒（HIV）感染人体后会破坏免疫系统，在免疫系统崩溃后任何一个普通的感染对人体来说都是致命的，艾滋病的危险性不在于HIV本身，而是感染HIV后的各种机会性感染所带来的并发症。
在生命起源初期是没有完善的免疫系统的，免疫系统的进化是整个生命系统进化的重要基础，而免疫系统的进化则是在病毒等各种病原体的刺激下完成的。最后，病毒是食物链的重要参与者和支撑者。比如说，在浩瀚的海洋中，病毒的数量大得惊人，一杯海水（大约半升）中大约含有10万个种类约300亿个病毒，病毒每天会杀死海洋中20%的生命物质，释放其内容物供其它生命体利用，如果海洋中没有病毒，物质循环中就缺失了一个重要的链条，许多生命将难以得到生长繁衍的机会。
